快速解离率的高精度分辨率可以显著减少假阳性结果

在这篇技术说明中,我们展示了如何使用 Creoptix WAVE 来精确测量弱结合分子的快速解离率动力学。由于小柱设计能够实现 150 ms 的超快速转换时间,现在可以轻松发现低效命中结果,从而更成功地研发药物。

总结

如在基于片段的筛选库中发现的那些弱结合物,通常通过亲和力而非动力学来排序。这是因为标准仪器缺乏测量快速解离率的能力。然而,测量亲和力而非解离率会产生大量假阳性结果,延长工作流程并产生不必要的成本。

采用专有的格栅耦合干涉测量 (GCI)Creoptix WAVE 可以提供了高达 10s-1 的快速解离率分辨率。这使得能够在早期阶段准确选择真实命中结果,从而极大提高效率。 

通过测量甲基磺酰胺与碳酸酐酶 II 的结合动力学,我们发现 Creoptix WAVEsystem 在极快的解离率下也能实现出色的分辨率,即使靶标与分析物的分子量比值很大。

动力学数据
Creoptix WAVE Biacore™ S51
kon (M-1 s-1) 9.36 x 103 kon (M-1 s-1)
8.05 x 103
koff (s-1) 2.86 koff (s-1)
2.21
KD (uM) 306 KD (uM) 274

表 1:动力学数据与发表论文数据的比较:Myszka, David G. “Analysis of small-molecule interactions using Biacore S51 technology.”Analytical biochemistry 329.2 (2004): 316-323.

图例:(A) 甲基磺酰胺 (95.1 Da) 与碳酸酐酶 II (29 kDa) 结合的传感图,碳酸酐酶 II 通过胺偶联固定在 WAVEchip PCH 上,8500 pg/mm2,流动池 1。在 40Hz、流速 200 μL/分钟下采集数据。(B) 放大的结合相(左)和解离相(右),下面的残差分布图显示出动力学高清晰分辨率。

[图 1 TN201101-Creoptix-fast-off-rates-to-reduce-false-positives.jpg] 图 1 TN201101-Creoptix-fast-off-rates-to-reduce-false-positives.jpg

图 1:甲基磺酰胺 (95.1Da) 与碳酸酐酶 II (CAII) 结合。1 pg/mm2 = 1 RU

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