蛋白质的热展开:原理、方法与应用 – 什么是热展开?

热展开是指蛋白质在温度驱动下失去其天然三维结构。随着热能增加,稳定折叠态的非共价相互作用——氢键、疏水堆积、范德华接触——会逐步被破坏,蛋白质从有序、致密的构象转变为无序或部分有序状态。
这一转变通常以熔解温度(Tm)来表征:即折叠态与展开态群体各占一半时的温度。Tm并不是蛋白质在孤立状态下的固定物理常数——它取决于溶液条件、缓冲液组成,以及配体或辅料的存在——而这恰恰使它具有实用价值。比较不同条件或不同变体下的Tm,可以定量、可重复地衡量相对热稳定性。这种对环境的依赖并不局限于试管内:Leuenberger及其同事开展的全细胞热分析研究,在完整细胞内同时追踪数千种蛋白质的展开,表明热稳定性与结构和生物学特征相关,例如蛋白质大小、四级结构以及聚集倾向,而不仅仅由氨基酸序列决定。¹ 换句话说,热稳定性反映的是蛋白质更广泛的结构背景,而不只是其孤立折叠本身——这也解释了为什么体外的Tm变化是如此有信息量、且可推广地反映底层结构敏感性。
较高的Tm通常意味着分子具有更高的热稳定性,而Tm的变化是最快速地观察突变、缓冲液、辅料或制剂条件如何影响蛋白质稳定性的方法之一。
在生物制药开发中,这一点尤为重要,因为热稳定性与蛋白质在真实世界压力下的行为密切相关:制造、运输或储存过程中的升温;冻融循环;或者货架期中简单的温度暴露。较低或发生偏移的Tm是一个早期信号,提示该分子可能更容易受到这些压力的影响。
展开也在机制上与下游风险相关。随着蛋白质失去天然结构,原本埋藏的疏水残基会暴露于溶剂中。这些暴露表面是蛋白质-蛋白质缔合的主要驱动力,使部分或完全展开的物种更容易发生聚集。反过来,聚集又与生物活性下降、药代动力学改变以及——在生物制剂中——免疫原性风险相关。因此,热展开很少是人们单独关注的终点;它是结构不稳定性的替代指标,而这种不稳定性会先于这些下游失效模式出现,这也是为什么Llowarch等人将热转变描述为早期药物发现中最敏感、应用最广泛的蛋白质稳定性读出之一。²
如何测量热展开?
差示扫描量热法(DSC)和差示扫描荧光法(DSF)是测量热展开最常用的两种技术,它们探测的是根本不同的物理性质。
DSC直接测量热量。展开是吸热过程,因此会表现为热容峰值;从中无需依赖报告分子或预设的光谱模型,就可以提取Tm、展开焓(ΔH)以及热容变化(ΔCp)。这使DSC成为一种不依赖模型、热力学上直接的测量方法——也是其他方法通常据以验证的参考技术。
DSF则是光学且间接的:它跟踪的是随着结构丧失而变化的荧光信号。常规DSF使用外源染料,该染料会在展开时结合暴露的疏水表面。内源DSF作为一种完全无需标记的技术,则在加热蛋白质时跟踪色氨酸和酪氨酸残基的内源荧光。随着这些残基在展开过程中变得更暴露于溶剂,其发射光谱会发生位移,而将这种变化与温度作图即可得到起始温度和Tm。
这两者并不能互换。NIST的直接比较发现,DSC和DSF测得的Tm值常常一致,但并非总是如此。结果取决于扫描速率,而方法选择也会显著改变所获得的转变温度——这提醒我们,“如何测量”和“测量什么”同样重要。³ 因为展开过程通常更多受动力学而非纯热力学控制。³
这就是为什么这些技术是互补而非可替代的:DSC提供热力学深度,DSF提供通量。将DSF用于早期广泛筛选,并用DSC确认和表征筛选出的候选物,可以弥补各自的主要局限——这也反映了当前药物发现中的实践:位移分析作为主要筛选手段,而量热方法提供正交确认。² DSC和DSF报告的是构象,而不是蛋白质开始展开之后发生了什么。动态光散射(DLS)则弥补了这一空白:DLS通过分析散射光的波动来测量溶液中颗粒的尺寸,因此对更高级别物种——二聚体、寡聚体以及更大聚集体——在样品加热时的出现极为敏感。与 DSF 或 DSC 一同进行热升温实验时,SLS 可揭示蛋白质聚集起始温度(Tagg),同时结合 DLS 检测到的流体动力学半径变化,显示蛋白质展开事件之后是否发生了自我缔合。
DLS和SLS:补全全貌
静态光散射(SLS)又增加了一层热力学信息。通过散射强度对浓度的依赖关系,SLS可直接获得第二维里系数B22——这是蛋白质-蛋白质净相互作用的度量。与传统上仅由DLS推导出的扩散相互作用参数kD相比,这是一种更严格的读出:kD具有经验性,并且会把真实热力学相互作用与水动力和摩擦效应混合在一起,有时甚至会扭曲或反转表观相互作用的符号。B22不受这些水动力伪影影响,因此是胶体稳定性、溶解性和聚集倾向更直接、更可靠的预测指标。
将构象分析(DSF或DSC)、尺寸分析(DLS)和热力学相互作用分析(SLS)结合起来,就能把一次热扫描转化为完整图景——不仅知道蛋白质何时展开,还能知道它是否、以多大强度、以及在什么条件下继续发生自缔合。
为什么要将DSF与高通量DLS/SLS结合?
展开和聚集彼此相关,但并不是同一事件,而且它们并不总是同步发生。一个分子在构象上可以非常稳定,却仍然因为胶体不稳定性而在中等温度下聚集;相反,一个分子也可能在相对较低的Tm下展开,但并不会立刻形成可见聚集体。只测其中一种,可能会完全漏掉另一种失效模式。
这正是药物发现文献中关于热位移方法所强调的观点:由于这些分析建立在温度与蛋白质折叠/展开平衡之间的简单物理联系之上,因此当它们与正交检测方法结合、用以确认这种移动的平衡对样品到底产生了什么影响时,信息价值最高。⁴ 在同一块板上、沿同一热梯度对同一样品同时运行DSF和DLS/SLS,意味着每一个Tm值都可以用来自相同样品和相同加热曲线的Tagg值进行核对——无需第二次实验,无需单独分装,也无需担心不同分析之间的差异其实只是样品制备差异。
这种效率优势与科学价值同样重要。与其分别开展一次DSC实验、一次单独的DSF筛选,然后再进行DLS/SLS稳定性研究,不如采用整合的DSF/DLS/SLS流程,一次即可获得构象和胶体数据。对于制剂筛选和稳定性评估——需要比较数十种缓冲液、pH和辅料组合时——这种整合既节省样品,也节省时间,同时不牺牲数据集的深度和质量。
高通量分析的优势
高通量并不仅仅意味着更快;它改变了你能提出什么样的问题。基于微孔板的高通量DSF/DLS/SLS流程允许你在相同条件下、同一轮实验中并行比较数十种制剂、缓冲液或候选分子。
这种广度在开发早期最为重要,因为此时目标不是完整表征单一分子,而是比较多个分子并进行排序。在这一阶段生成稳健、可比的数据集——而不是只对少数条件获得深入但狭窄的数据——能为制剂和候选筛选团队提供更有力的决策依据。更快的筛选意味着更早作出决策,把更少资源浪费在那些本就不可能成功的候选物或条件上。最终效果正是所有生物制剂项目都在追求的:更短的开发周期,以及把材料和仪器时间用在最关键的地方。
在生物制剂中的应用
制剂开发。 将辅料、缓冲液、pH和离子强度与Tm和Tagg并行筛选,可以帮助制剂开发人员快速找到既能防止展开又能抑制聚集的条件,而不只是其中之一。
候选筛选。 当存在多个候选变体或突变体时,热稳定性分析是对它们进行排序最快的方法之一,可快速识别哪些候选物最不可能在后续制造或稳定性方面带来麻烦。
稳定性研究。 稳定性研究将展开和聚集行为结合起来,以建立分子在热应激下的风险画像。跨候选制剂或储存条件跟踪Tonset、Tm、Tagg和B22,不仅能显示蛋白质从何处开始失去结构,还能显示这种结构丧失是否会转化为自缔合——这正是及早发现易聚集条件所需的组合,避免其在后续开发阶段才暴露出来。
更少投入,更多洞察。 在这三种应用场景中,将高通量内源DSF与高通量DLS/SLS配对的吸引力是相同的:以更少样品和更短时间生成更丰富、相关性更好的数据,而不必分别运行等效技术。
结论
热展开是研究蛋白质稳定性最具信息量的方法之一——但前提是你要看到全貌。将内源DSF与高通量DLS结合,可以在同一样品、同一热扫描中并排捕捉构象变化和聚集行为。实际收益很直接:更低的样品消耗、更快的制剂或候选物筛选,以及对制剂或分子筛选决策背后稳定性数据更高的信心。
参考文献
- Leuenberger P, Ganscha S, Kahraman A, et al. Cell-wide analysis of protein thermal unfolding reveals determinants of thermostability. Science. 2017;355(6327):eaai7825. https://www.science.org/doi/10.1126/science.aai7825
- Llowarch P, Usselmann L, Ivanov D, Holdgate GA. Thermal unfolding methods in drug discovery. Biophysics Reviews. 2023;4(2):021305. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10903397/
- Lang BE, Cole KD. Measurement of the Thermal Unfolding of Proteins by Differential Scanning Calorimetry and Fluorescent Reporter Dyes. National Institute of Standards and Technology. https://www.nist.gov/publications/measurement-thermal-unfolding-proteins-differential-scanning-calorimetry-and
- Thompson A. Employing thermal protein unfolding to search for new drugs. Scilight. 2023;2023(20):201108. https://pubs.aip.org/aip/sci/article/2023/20/201108/2890803/Employing-thermal-protein-unfolding-to-search-for
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